1990 yılında, Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden mezun olan Ecer, 1990-1995 yılları arasında Nevşehir Ürgüp Devlet Hastanesi’nde Acil Hekimi olarak çalışmıştır.
Uzmanlık eğitimini 1995-1999’da Konya Selçuk Üniversitesi İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı’nda tamamlayan Dr. Ecer, 1999-2001’de aynı üniversitede İç Hastalıkları Uzmanı olarak çalışmıştır.
Dr. Mehmet Ali Ecer, 2001-2008’de Afyon Devlet Hastanesi’nde, 2008-2017’de Afyon Özel Park Hayat Hastanesi’nde, 2017-2018’de de Bursa Özel Ceylan Hastanesi’nde çalışmıştır.
Özellikle diyabet ve obezite konusunda birçok bilimsel çalışması bulunan Ecer, evli ve 2 çocuk babasıdır. Dr. Ecer, İngilizce bilmektedir.